工业生产主要是从事农产品、畜产品加工，以及各工匠从事的家庭手工业。矿业开采处于起步阶段，人工开采茶卡、柯柯盐矿，开采大通煤窑，规模较前有所发展。乾隆后，开采境内砂金，有一定规模的如札马尔图金矿(见清末全矿开采)。商业贸易逐步繁荣。清初沿袭前代继续实行茶马互市制度，由西宁荼马司办理。雍正十三年(1735年)，清廷结束了延续一千余年的茶马互市制度，官方所用的马匹通过贡赋形式征集，茶马贸易转由民间经营。西宁等城镇是民族贸易的中心，乾隆时就出现有山西、陕西等地商人办的商号、会馆。雍正时，蒙藏各部与内地贸易地点由那萨拉(日月山)改在丹噶尔，使丹地商业发达，人口增加，嘉庆、道光时商业十分兴盛，成为农、牧区之间贸易的重要市场(见丹噶尔城贸易)。光绪后，青海畜产品开始落入外商之手，“西宁毛”在国际市场享有盛誉(见西宁毛外销)。
清代交通运输有新的发展。在东部农业区形成了以西宁府为中心的驿道网络，在西部柴达木地区有通向**、新疆和甘肃河西走廊的道路。青藏大道是内地联系**的重要桥梁，自西宁至拉萨大昭寺共67程，3670余里，虽路途艰辛，但贡市往来、民间商队仍畅通于世界屋脊的这条道路上。运输主要靠陆路交通，用牲畜马车驮运。(见清代青藏驿道)循化、贵德、民和等地黄河上有渡船运输。光绪后，外国洋行利用皮筏水运青海羊毛可至兰州、包头等地，再经张家口、天津出口。光绪末，改驿归邮，成立西宁府邮政分局，并在部分县城设立代办所，办理信函、汇兑等业务(见青海开办邮政业务)。清代初、中期，在府城、县城办有少数儒学、社学、书院，光绪后改设为中学堂、小学堂。中后期，西宁及部分县城曾设立回民社学、义学。宣统时在西宁设蒙古半日制学堂(后改为宁海蒙番小学)，但学生较少。清代编修的地方志如顺治《西宁志》，乾隆《西宁府新志》、《循化志》，光绪《西宁府续志》等，保存了地方历史和现状的史料，成为今天宝贵的文化遗产。
辛亥革命后，在青海的清朝地方官自动离职。北洋政府废青海办事大臣，改设青海办事长官。1912年9月，袁世凯任命原西宁府知府廉兴为青海办事长宫，任命马麒为西宁镇总兵。次年，廉、马共同主持祭海会盟，宣布清帝退位、民国成立的消息，劝蒙藏头人联名致电北洋政府，表示拥护共和。自此青海全境正式归附中华民国。
马麒到职后，积极扩军，组建宁海军。1915年，廉兴被查办，马麒任甘边宁海镇守使兼蒙番宣慰使，集军政大权于一身。这样，青海地区结束了前清数百年来政令不一的局面，同时为马氏家族统治青海奠定了牢固的基础。1925年，国民军入甘。次年，冯玉祥任马麒为青海护军使，马麒所部军队接受国民军改编(见国民军入青)。1928年10月17日，国民党中央政治会议决定将甘肃省西宁道属7县及原青海办事长官所辖蒙古29旗、玉树25族、环海8族、果洛等地划出，成立青海省，西宁为省会，任命孙连仲为首届省主席(见青海建省)。孙任期不到一年，此后依次由马麒、马麟、马步芳任青海省主席或代主席。
青海建省初，全省人口约有93万。民国时多次增设县、设治局等，行政区划屡有变动。至1943年已有l9县、6设治局。1947年，全省辖1市(西宁市)；1地(玉树行政督察区)；19县：大通、湟中、互助、乐都、民和、循化、贵德、化隆、湟源、共和、门源、玉树、都兰、兴海、同仁、囊谦、称多、海晏、同德县；还有祁连设治局、星川设治局。已改县或裁撤的设治局有海晏、兴海、通新、香德、西乐、和顺等。马步芳控制青海军政权力后，青海表面上服从国民政府，青海军队也列入国民政府军的序列，但马氏军阀在其控制的地盘内享有相当
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